尊龙凯时的虚拟筛选(Virtual Screening, VS)是一种基于小分子数据库进行活性化合物筛选的方法。通过对小分子化合物与药物靶标之间的分子对接运算,虚拟筛选能够迅速从数十至数百万分子中筛选出具有潜在药用价值的活性化合物。这一过程显著降低了实验筛选化合物的数量,缩短了研究周期,并有效降低了药物研发的成本。相关研究表明,虚拟筛选的阳性率在5%到30%之间,利用虚拟筛选成功辅助药物设计的案例逐年增多,使其成为如今极具潜力的药物开发工具。
尊龙凯时的虚拟筛选具有多项优势,利用小分子化合物与药物靶标的分子对接计算,能够快速筛选出具有成药性的活性化合物,从而大幅减少实验筛选中所需的化合物数量。该方法不仅周期短、成本低且阳性率高,为药物研发提供了高效的解决方案。
虚拟筛选的方法分类
虚拟筛选的主要方法分为基于受体的虚拟筛选(Structure-Based Virtual Screening, SBVS)和基于配体的虚拟筛选(Ligand-Based Virtual Screening, LBVS)。基于受体的虚拟筛选是依靠实验测定或同源模建的受体生物大分子的三维结构,通过分子对接确定小分子与受体的结合模式,并利用相关的亲合性打分函数评估其结合能力,从中筛选出结合模式合理且得分较高的化合物,以供后续的生物活性测试。基于配体的虚拟筛选,则是通过分析现有药物的结构和理化性质,建立定量构效关系或药效基团模型,以预测并筛选出新化合物的活性。
虚拟筛选的关键因素
进行虚拟药物筛选的关键在于准确测定或预测靶标蛋白质的分子结构,并精确快速地计算候选化合物与靶标之间相互作用的自由能变化。这些因素不仅是虚拟筛选的成功基础,更是其准确性的重要瓶颈。
虚拟筛选的阳性率分析
据相关报道,虚拟筛选的阳性率为5%至30%。随着越来越多成功案例的出现,虚拟筛选已成为药物开发领域最具潜力的工具之一。
虚拟筛选项目报告内容
一般情况下,尊龙凯时会根据筛选结果提供每个化合物库中排名前200名化合物的结构式及相关信息(包括SDF、PDF、EXCEL格式的文件),同时提供综合排名前5名化合物与靶蛋白的对接模式图(包括2D和3D图)。此外,还将生成一份包含靶蛋白背景调研、筛选流程及优选化合物对接模式分析的PDF项目报告。
虚拟筛选流程
虚拟筛选过程主要分为基于受体的虚拟筛选(SBVS)和基于配体的虚拟筛选(LBVS)。基于受体的虚拟筛选通过对受体生物大分子的三维结构进行分子对接,能够评估小分子与受体的结合能力,选出最合适的候选化合物进行生物活性测试。而基于配体的虚拟筛选则依赖于药效团模型,通过分析现有药物的活性关系来预测新化合物的活性。
尊龙凯时拥有丰富的数据库资源和高性能的计算机服务器,可以提供专业的分子对接和虚拟筛选服务。经过优化的虚拟筛选方案不仅能够在大规模上减少需实验筛选的化合物数量,提升理想先导物发现的可能性,还能缩短服务时间并降低后期先导物优化失败的风险。我们可以根据客户的具体需求,量身打造高性价比的服务方案,为广大科研客户提供优质的早期药物研发服务。
服务内容
尊龙凯时致力于为有虚拟药物筛选需求的客户提供完整的服务体系。客户只需提供靶标相关的生物学信息,我们将为您筛选出最佳的活性化合物,为后续的生物活性评价奠定坚实基础。服务内容包括:
- 靶点调研
- 模型构建
- 小分子化合物库制备
- 分子对接筛选/药效团建模及筛选
- 人工挑选
- 理想实体化合物的组库服务
服务优势
尊龙凯时在虚拟筛选领域的优势包括:
- 高性能的计算机服务器
- 丰富的数据库资源,涵盖1600万+可购买化合物
- 专业的分子模拟和药物设计团队
- 严格的数据隐私管理
- 具有竞争力的价格优势